Dans les débats scientifiques actuels, la référence à Charles Darwin et à la théorie de la sélection naturelle est constante. Mais qui est l'homme qui a autant marqué l'histoire des sciences naturelles ?

Dans ce film, Darwin se livre à travers des extraits de son autobiographie ou de ses lettres. Il partage avec nous ses enthousiasmes, ses doutes, ses affections. Il nous raconte son peu d'intérêt pour l'école, sa passion pour les coléoptères puis, à travers son journal de bord, son voyage en Amérique du Sud à bord du Beagle... Qu'est-ce que la nature ?

Ce documentaire restitue Darwin dans son contexte historique, dans son environnement scientifique et familial, et relate les moments déterminants de sa vie. Il explique les idées dominantes de son époque, comme celle de la fixité des espèces dont Darwin allait douter de plus en plus. De son environnement scientifique, il raconte le soutien de ses amis qui le poussent à publier sa théorie et qui le défendent vigoureusement dans des débats tels que la bataille d'Oxford entre la science et la religion.

Il donne également les éléments essentiels de la théorie darwinienne et la resitue dans la science contemporaine. À ce dialogue entre une voix intérieure et une voix extérieure correspond l'entrelacement de documents d'époque et d'images d'aujourd'hui. Le film présente les lieux où Darwin a vécu, mais fait aussi comprendre ce que le naturaliste a « vu » dans la nature. Il révèle des correspondances étonnantes, met en évidence l'unité du vivant et invite le spectateur à s'interroger, comme le fit Darwin lui-même.